Karakterisasi Isolat Bakteri Endofit Nilam (Pogostemon cablin B.) sebagai Kandidat Biostimulan Pertumbuhan Tanaman

Rafika Yuniawati, Alina Akhdiya

Abstract


Simbiosis bakteri endofit pada tanaman nilam telah diketahui berpotensi untuk menstimulasi pertumbuhan tanaman. Penelitian ini bertujuan untuk menyeleksi dan mengarakterisasi kemampuan bakteri endofit nilam (Pogostemon cablin B.) dalam menstimulasi pertumbuhan tanaman nilam. Bakteri endofit diisolasi dari beberapa sumber tanaman nilam, yaitu koleksi klon B6 (koleksi BB Biogen), varietas Sidikalang dan Patchoulina. Isolat bakteri endofit yang diisolasi dan diseleksi berdasarkan beberapa pengujian selanjutnya dikarakterisasi secara fisiologi, biokimia, dan genetik. Karakterisasi fisiologi dan biokimia meliputi uji aktivitas penghambatan bakteri fitopatogen, uji potensi fiksasi N dan pelarut fosfat, serta uji penghasil IAA-like compound, sedangkan karakterisasi genetik dilakukan berdasarkan analisis sekuensing 16srRNA. Hasil penelitian yang diperoleh menunjukkan empat belas isolat terdeteksi menghasilkan IAA like compounds. Empat dari 29 isolat tidak berpotensi patogenik, yaitu isolat B63.8,
B63.10, NSD 20, dan P 35. Isolat-isolat ini mampu memfiksasi nitrogen dan melarutkan fosfat. NSD 20 merupakan isolat yang paling potensial untuk dikembangkan sebagai kandidat biostimulan. Berdasarkan hasil karakterisasi genetik, isolat NSD 20 ini menunjukkan kemiripan tertinggi dengan Bacillus sp. Y14 (93,95%). Uji lanjut in planta di rumah kaca dan lapang diperlukan
untuk mengetahui kemampuan stimulasi pertumbuhan tanaman nilam oleh Bacillus sp. NSD 20.


Keywords


Endofit; penambat nitrogen; pelarut fosfat; IAA; biostimulan

Full Text:

PDF

References


Aji, O.R. & Utami, L.B. (2017) Isolasi dan karakterisasi bakteri endofit tanaman tomat cherry (Solanum lycopersicum var. cerasiforme) dalam kemampuannya menghasilkan hormone asam indol asetat

(IAA). Gontor Agrotech Science Journal, 3 (1), 55–69. doi: 10.21111/agrotech.v3i1.909.

Akhdiya, A. (2014) Karakterisasi bakteri endofit penghasil volatile organic compound (VOC’s) untuk meningkatkan ketahanan tanaman kentang terhadap penyakit layu bakteri. Disertasi S3. Institut

Pertanian Bogor.

Bacon, C.W & Hinton, D.M. (2006) Bacterial endophytes: the endophytic niche, its occupants, and its utility. In: Gnanamanickam S.S. (ed.) Plant Associated Bacteria. Netherland, Springer, pp. 155-194.

Daub, M.E. (1986) Tissue culture and the selection of resistance to pathogens. Annual Review of Phytophatology, 24, 159-165.

Faria, D.C., Dias, A.C.F., Melo, I.S. & Costa, F.E.C. (2013) Endophytic bacteria isolated from orchid and their potential to promote plant growth. World Journal of Microbiology and Biotechnology, 29 (2),

221. doi: 10.1007/s11274-012-1173-4.

Franche, C., Lindstrom, K. & Elmerich, C. (2009) Nitrogen-fixing bacteria associated with leguminous and non-leguminous plants. Plant Soil, 321, 35-59.

Glickmann, E. & Dessaux, Y. (1995) A Critical examination of the specificity of the Salkowski reagent for indolic compounds produced by phytopathogenic bacteria. Applied and Environmental Microbiology. 61 (2), 793–796.

Gupta, G., Parihar, S.S., Ahirwar, N.K., Snehi, S.K. & Singh, V. (2015) Plant growth promoting rhizobacteria (PGPR): Current and future prospects for development of sustainable agriculture. Journal

of Microbial & Biochemical Technology, 7, 096–102. doi:10.4172/1948-5948.1000188.

Ji, S.H., Gururani, M.A & Chun, S.C. (2014) Isolation and characterization of plant growth promoting endophytic diazotrophic bacteria from Korean rice cultivars. Microbiological Research, 169 (1), 83-98. doi: 0.1016/j.micres.2013.06.003.

Krausse, R., Pienning, K & Ullmann, U. (2005). Inhibitory effects of various micro-organisms on the growth of Helicobacter pylori. Letters in Applied Microbiology, 40 (1), 81-86. doi:10.1111/j.1472-

X.2004.01632.x.

Krismawati, A. (2005) Nilam dan potensi pengembangannya Kalteng jadikan komoditas rintisan. [Online] Tersedia pada http:// new.litbang.pertanian.go.id [Diakses 12 Oktober 2020].

Leiwakabessy (2011). Respon hipersensitif. Bogor, Institut Pertanian Bogor. Malfanova, N.V. (2013) Endophytic bacteria with plant

growth promoting and biocontrol abilities. PhD Dissertation. University of Leiden.

Marchesi, J.R., Sato, T., Weightman, A.J., Martin, T.A., Fry, J.C.,Hiom, S.J., Dymock, D. & Wade, W.G. (1998) Design and evaluation of useful bacteriumspecific PCR primers that amplify genes coding for

bacterial 16S rRNA. Applied and Environmental Microbiology, 64 (2), 795-799.

Munif, A., Wiyono, S., & Suwarno (2012) Pemanfaatan bakteri endofit untuk meningkatkan pertumbuhan dan kesehatan tanaman padi gogo. Dalam: Prastowo, Sulistiono, Suprayogi, A., Saharjo, B.H.

(Editor). Prosiding Seminar Hasil-hasil Penelitian IPB 2012. Bogor, Institut Pertanian Bogor, hlm. 349-417.

de Oliveira Costa, L.E., de Queiroz, M.V., Borges, A.C. de Moraes, C.A. & de Araújo, E.F. (2012) Isolation and characterization of endophytic bacteria isolated from the leaves of the common bean (Phaseolus

vulgaris). Brazilian Journal of Microbiology, 43 (4), 1562-1575.

Pavlo, A., Leonid, O., Iryna, Z., Natalia, K. & Maria, P.A. (2011) Endophytic bacteria enhancing growth and disease resistance of potato (Solanum tuberosu L.). Biological Control, 56 (1), 43-49. doi:

1016/j.biocontrol.2010.09014.

Purwanto, U.M.S., Pasaribu, F.H. & Bintang, M. (2014) Isolasi bakteri endofit dari tanaman sirih hijau (Piper betle L.) dan potensinya sebagai penghasil senyawa antibakteri. Current Biochemistry, 1 (1),

-57.

Ruangsanka, S. (2014) Identification of phosphatesolubilizing bacteria from the bamboo rhizosphere. Science Asia, 40, 204211. doi: 10.2306/-scienceasia1513-1874.2014.40.204.

Sabu, R. & Radhakrishnan, E.K. (2016) Bioprospecting of endophytic bacteria from Zingiber officinale with antibacterial activities. International Journal of Current Microbiology and Applied Sciences, 5 (9),462-467. doi: 10.20546/ijcmas.2016.509.050.

Simarmata, R., Lekatompessy, S. & Sukiman, H. (2007) Isolasi mikroba endofitik dari tanaman obat sambung nyawa (Gynura procumbens) dan analisis potensinya sebagai antimikroba. Berkala Penelitian Hayati, 13, 85–90.

Song, L., Hobaugh, MR., Shustak, C., Cheley, S., Bayley, H. & Gouaux, J.E. (1996) Structure of staphylococcal alpha-hemolysin, a heptameric

transmembrane pore. Science, 274, 1859–1866. doi: 10.1126/science.274.5294.1859.

Suhandono, S., Kusumawardhani, M.K. & Aditiawati, P. (2016) Isolation and molecular identification of endophytic bacteria from rambutan fruits (Nephelium lappaceum L.) cultivar Binjai. HAYATI

Journal of Biosciences, 23, 39-44. doi: 10.4308/hjb.23.1.39

Suliasih & Rahmat (2007) Aktivitas fosfatase dan pelarutan kalsium fosfat oleh beberapa bakteri pelarut fosfat. Biodiversitas, 8 (1), 23-26.

Susilowati, D.N., Saraswati R., Elsanti & Yuniarti, E. (2003) Isolasi dan seleksi mikroba diazotrof endofitik dan penghasil zat pemacu tumbuh pada tanaman padi dan jagung. Dalam: Mariska, I., Somantri, I.H., Sutrisno, Machmud, M., Simanungkalit, R.D.M., Suyono & Orbani, I.N. (editor) Prosiding Seminar Hasil Penelitian Rintisan dan Bioteknologi Tanaman, 30-31 Januari2001. Bogor, Balai Penelitian Bioteknologi dan Sumberdaya Genetik Pertanian, hlm. 128-143.

Tamura, K., Stecher, G., Peterson, D., Filipski, A. & Kumar, S. (2012) MEGA6: Molecular evolutionary genetics analysis version 6.0. Molecular Biology and Evolution, 30 (12), 2725-2729. doi:

1093/molbev/mst197. Epub 2013 Oct 16.

World Health Organization (WHO) (2009) Modul 3: Blood group serology. Switzerland, WHO Press. Wahyudi, A.T., Meliah, S. & Nawangsih, A.A. (2011) Xanthomonasi oryzae pv. oryzae bakteri penyebab hawar daun pada padi: Isolasi, karakterisasi, dan

telaah mutagenesis dengan transposon. MakaraSains, 15, 89-96.




DOI: http://dx.doi.org/10.21082/blpn.v27n1.2021.p21-28

Refbacks

  • There are currently no refbacks.




Copyright (c) 2021 Buletin Plasma Nutfah

 


       


Buletin Plasma Nutfah

Jalan Tentara Pelajar 3A, Bogor 16111
Jawa Barat, Indonesia
Phone: (0251) 8339793, 8337975
Call Centre: 08211181677
Fax: (0251) 8338820
E-mail: buletin.plasmanutfah@gmail.com
Website: http://biogen.litbang.pertanian.go.id

ISSN    : 1410-4377
E ISSN : 2549-1393

Accreditation Number200/M/KPT/2020





View My Stats